In una ipotetica città F della prefettura F, c'è una società segreta, formata da due persone (ma presto diventeranno 3), che ha la propria base segreta nelle fogne: il capo, sua eccellenza Il Palazzo, e la sua sottoposta, Excel. Il loro obbiettivo è la conquista del mondo... ma per il momento si accontentano della città . Dall'altra parte c'è uno strano individuo, di cui non si ha ben chiara la posizione sociale, che ha creato un nuovo dipartimento, quello della protezione ambientale, atto a difendere la città da eventuali invasioni. Casualmente gli obiettivi delle due organizzazioni contrastano... Intanto si svolge la triste storia di Pedro, lavoratore brasiliano in Giappone, che muore durante un incidente causato dalla stessa Excel. Tornando a casa sotto forma di fantasma, scopre che un uomo le ha rubato la moglie e il figlio. Comincia all'ora una dura battaglia per strappare i due dalle grinfie di Quell'Uomo... Un'altra stoira parallela è quella di Nabeshin, regista dell'anime, che gira per il mondo raccogliendo vecchi compagni e saldando conti in sospeso (e scappando dalla minestrina di una misteriosa ragazza).
